El manatí está considerado desde 1975 en peligro de extinción por la Convención sobre el Comercio Internacional de Especies Amenazadas de Fauna y Flora Silvestres (CITES) y desde el año de 1982, como especie vulnerable por la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza (UICN).
La pérdida de su hábitat por las actividades de los humanos es la principal amenaza que estos animales enfrentan, ya que no cuentan con depredadores enemigos y además es un mamífero hervíboro, por lo que su alimento consiste en grandes cantidades diarias de algas y lirios.
